Ciao,
come giustamente affermi nel mondo è sicuramente più utilizzato il .com, ma in Italia chiaramente viene utilizzato di gran lunga di più il .it.
In sostanza dipende dal target dei tuoi utenti, e dalla lingua del tuo sito: se sono entrambi italiani preoccupati soprattutto dei risultati sul .it.
Scostamenti nel ranking del tuo sito sui differenti motori sono generalmente da attribuirsi ai siti che ti linkano forti su uno piuttosto che su un altro motore.
Cordiali saluti