Mi dispiace, ma non è possibile inserirlo nel css: devi optare per altre soluzioni (usare un frame, trasformare l'swf in gif, metterci sopra un layer, variabile php e LoadVars, proprietà css z-index, fare due file dandone uno ai cookie...)
Se vuoi un consiglio però, usa dreamweaver che ha proprio la funzione sotto inserisci > oggetto multimediale > flash, poi inserisci l'oggetto in un div in modo da controllarne la posizione: te lo caricherà ad ogni pagina, ma fai prima ad alleggerire il file flash (nel caso il sito fosse troppo lento).
Lodovico